It was a perfectly innocent question.是什么意思？

It was a perfectly innocent question.

那是个完全没有恶意的问题。

it

pron. 它，他，正好是所需的，事实[情况]；n. <美俚>傻瓜，笨蛋，<俚>绝妙的人，理想的东西，登峰造极；

例句
I suggest you leave it to an expert...
我建议你把它留给专家来解决。

was

v. 用来表示某人或某物即主语本身，用来表示某人或某物属于某一群体或有某种性质（ be的过去式 ），在，存在，不受干扰；

例句
There was a terrible sadness in her eyes...
她眼神中流露出深深的悲伤。

perfectly

adv. 完美地，理想地，完全地，无瑕疵地；

例句
A coefficient of one means the markets move perfectly in step.
系数为1表示各个市场的步调完全一致。

innocent

adj. 无辜的，无罪的，清白的，天真无邪的，无知的；n. 无辜者，头脑简单的人，天真无邪的人；

例句
It makes my blood boil to think two thugs decided to pick on an innocent young girl.
一想到两个暴徒要欺负一个天真的小姑娘，我就满腔怒火。

question

n. 问题，疑问，怀疑，议题；vt. 问（某人）问题，对（某事物）表示[感到]怀疑；

例句
...certain assumptions which are accepted without question as absolute truths.
某些未经质疑就被作为绝对真理而全盘接受的假设